Отдел ?1 "Теории проектирования освоения недр"

Отдел ?2 "Стратегии освоения и сохранения недр"

Отдел ?3 "Геотехнологических проблем комплексного освоения недр"
    -> Лаборатория геотехнологий глубоких горизонтов месторождений твердых полезных ископаемых
    -> Лаборатория геоинформационных систем геотехнологий

Отдел ?4 "Проблем комплексного извлечения минеральных компонентов из природного и техногенного сырья":
    -> Лаборатория теории разделения минеральных компонентов
    ->  Лаборатория комплексной переработки нетрадиционного минерального сырья

Отдел ?5 "Проблем геомеханики и разрушения горных пород"

Отдел ?6 "Проблем горной аэрогазопылединамики и безопасности освоения недр"

Отдел ?7 "Аналитический центр изучения природных веществ при комплексном освоении недр"

Отдел ?8 "Научной информации и проблем управления освоением недр"

Отдел ?9 "Горной экологии"